Malheureusement, après avoir perdu la majeure partie de ses cadres, les deux saisons qui suivront seront bien moins riches en émotions, tant et si bien que l'ASM, qui se dénomme à présent Association Sportive de Monaco Football Club SAM, est éliminée dès le premier tour de la Ligue des Champions, et surtout termine 12ème du championnat. Seul rayon de soleil, une finale de Coupe de la Ligue, mais perdue face à Lyon 2-1 après prolongation.
La saison qui suivait devait être celle du renouveau. Didier Deschamps arrivait comme entraîneur en lieu et place de Claude Puel, et surtout Panucci, Bierhoff, Jugovic et d'autres débarquaient sur le Rocher. Malheureusement, cette saison sera l'une des pires du Club, avec une 15ème place en championnat. Rien ne laissait présager que l'ASM FC ne rebondisse aussi rapidement.
En 2002 - 2003, après pourtant un départ poussif, les Rouge et Blanc terminent 2èmes du championnat et remportent la Coupe de la Ligue, au stade de France, devant 80 000 spectateurs. Shabani Nonda sera élu meilleur buteur du championnat, Jérôme Rothen meilleur passeur, et de nombreux jeunes tels que Squillaci et Evra seront reconnus comme de futurs membres de l'équipe de France. L'AS Monaco FC remporte donc une nouvelle compétition, trois ans après la dernière, et gagne le droit de disputer la lucrative Ligue des Champions.
Le 30 juin 2003, après vingt-huit années passées à la tête de l'AS Monaco FC, le Docteur Jean-Louis Campora quitte la Présidence. Il est remplacé par Monsieur Pierre Svara, membre du Conseil d'Administration depuis 2003. L'Association Sportive de Monaco Football Club prend un nouveau départ.
Le début de saison 2003 - 2004 conduit en décembre les Rouge et Blanc à la première place du championnat de L1 et les qualifie brillamment pour les huitièmes de finale de la Ligue des Champions, alors que ses adversaires se nommaient AEK Athènes, PSV Eindhoven et Deportivo La Corogne.
L'aventure européenne aura toutefois quelques conséquences sur le classement final. Après avoir occupé la 1ère place pendant les 3/4 du championnat l'AS MONACO FC finira effectivement sur le podium mais épuisée, seulement à la 3ème place !
La saison 2003 - 2004 a permis de partager une aventure sportive et humaine exceptionnelle, très forte en émotions, unique au niveau du suspense et riche sur le plan de la répétition d'exploits sportifs collectifs. Ses qualifications successives aux dépens du LOKOMOTIV MOSCOU, du REAL MADRID et de CHELSEA ont conduit l'AS MONACO FC à la finale de l'UEFA Champions League perdue contre le FC PORTO.
Le 30 juin 2004, Monsieur Michel PASTOR, puissant industriel monégasque, devient le nouveau président du club vice-champion d'Europe, la mission d'un an confiée à Monsieur Pierre SVARA au 30 juin 2003 étant venue à échéance.
La saison 2004-2005 voit l'AS Monaco s'offrir des places d'honneur dans les compétitions nationales. Troisièmes de Ligue 1 derrière l'OL et le LOSC, les coéquipiers de Saviola, Kallon et Chevanton, tous arrivés en début de saison, s'arrêtent en demi-finales des deux coupes nationales. Sur la scène européenne, le club termine à une belle première place en phase de poule de la Ligue des Champions (devant Liverpool, futur vainqueur de l'épreuve), mais se heurte au PSV Eindhoven en huitièmes de finale.
L'exercice suivant est plus chaotique. Une élimination contre le Betis Séville en tour préliminaire de C1 et un début de saison poussif en championnat provoquent le départ de Didier Deschamps. L'Italien Francesco Guidolin reprend le flambeau mais la formation monégasque a du mal à trouver la régularité. 10eme de Ligue 1, éliminée en demi-finale de la Coupe de la Ligue et en 16èmes de finale en Coupe UEFA, l'ASM FC se prépare à des changements marquants à la direction. A l'aube de la saison 2006-2007, Michel Pastor nomme Marc Keller comme Directeur Général du club. L'arrivée de Laszlo Bölöni à la tête de l'équipe première suivra de peu. Souhaitant s'appuyer sur l'expérience de ses cadres, mais aussi sur un centre de formation qui a fait ses preuves par le passé, l'AS Monaco entre avec enthousiasme et ambition dans une nouvelle ère.
